Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI48

Jsrp1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jsrp1Q3MI48 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jsrp1Q3MI48 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Jsrp1Q3MI48 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Jsrp1Q3MI48 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jsrp1Q3MI48 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jsrp1Q3MI48 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jsrp1Q3MI48 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jsrp1Q3MI48 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jsrp1Q3MI48 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Jsrp1Q3MI48 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jsrp1Q3MI48 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jsrp1Q3MI48 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Jsrp1Q3MI48 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Jsrp1Q3MI48 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Jsrp1Q3MI48 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Jsrp1Q3MI48 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Jsrp1Q3MI48 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Jsrp1Q3MI48 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Jsrp1Q3MI48 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Jsrp1Q3MI48 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Jsrp1Q3MI48 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Jsrp1Q3MI48 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jsrp1Q3MI48 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jsrp1Q3MI48 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jsrp1Q3MI48 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jsrp1Q3MI48 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jsrp1Q3MI48 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jsrp1Q3MI48 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jsrp1Q3MI48 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jsrp1Q3MI48 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jsrp1Q3MI48 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jsrp1Q3MI48 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jsrp1Q3MI48 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jsrp1Q3MI48 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jsrp1Q3MI48 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jsrp1Q3MI48 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jsrp1Q3MI48 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jsrp1Q3MI48 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jsrp1Q3MI48 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jsrp1Q3MI48 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms