Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3KNL4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3KNL4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3KNL4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3KNL4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3KNL4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3KNL4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3KNL4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3KNL4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3KNL4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3KNL4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3KNL4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3KNL4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3KNL4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3KNL4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3KNL4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3KNL4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3KNL4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3KNL4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3KNL4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3KNL4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3KNL4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3KNL4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3KNL4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3KNL4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3KNL4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3KNL4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3KNL4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3KNL4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3KNL4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q3KNL4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Q3KNL4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3KNL4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3KNL4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3KNL4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3KNL4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms