Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KncnQ307W7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KncnQ307W7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KncnQ307W7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KncnQ307W7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KncnQ307W7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KncnQ307W7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KncnQ307W7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KncnQ307W7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
KncnQ307W7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KncnQ307W7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KncnQ307W7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KncnQ307W7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KncnQ307W7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KncnQ307W7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KncnQ307W7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KncnQ307W7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KncnQ307W7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KncnQ307W7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KncnQ307W7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KncnQ307W7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KncnQ307W7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KncnQ307W7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KncnQ307W7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KncnQ307W7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KncnQ307W7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KncnQ307W7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KncnQ307W7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms