Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cpne9Q1RLL3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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