Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cers3Q1A3B0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cers3Q1A3B0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
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