Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
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ptchd1Q14B62 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ptchd1Q14B62 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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ptchd1Q14B62 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ptchd1Q14B62 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
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ptchd1Q14B62 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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