Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp2b3Q0VF55 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp2b3Q0VF55 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2b3Q0VF55 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms