Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tigd2Q0VBL1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tigd2Q0VBL1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms