Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem52bQ0VBF2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem52bQ0VBF2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms