Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab42Q0PD08 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms