Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SobpQ0P5V2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SobpQ0P5V2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SobpQ0P5V2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SobpQ0P5V2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SobpQ0P5V2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SobpQ0P5V2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SobpQ0P5V2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SobpQ0P5V2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SobpQ0P5V2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SobpQ0P5V2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SobpQ0P5V2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SobpQ0P5V2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SobpQ0P5V2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SobpQ0P5V2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SobpQ0P5V2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SobpQ0P5V2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SobpQ0P5V2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SobpQ0P5V2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SobpQ0P5V2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SobpQ0P5V2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SobpQ0P5V2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SobpQ0P5V2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SobpQ0P5V2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SobpQ0P5V2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SobpQ0P5V2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SobpQ0P5V2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms