Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubxn2bQ0KL01 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn2bQ0KL01 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms