Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc7a1Q09143 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc7a1Q09143 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc7a1Q09143 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 503.4 ms