Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q08AU9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q08AU9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q08AU9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q08AU9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q08AU9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q08AU9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q08AU9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q08AU9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q08AU9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q08AU9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q08AU9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q08AU9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q08AU9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q08AU9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q08AU9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q08AU9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q08AU9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q08AU9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q08AU9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q08AU9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Q08AU9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q08AU9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q08AU9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q08AU9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q08AU9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q08AU9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q08AU9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q08AU9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q08AU9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q08AU9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q08AU9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q08AU9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q08AU9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q08AU9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q08AU9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q08AU9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q08AU9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q08AU9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q08AU9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q08AU9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q08AU9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q08AU9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q08AU9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q08AU9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q08AU9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q08AU9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q08AU9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q08AU9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q08AU9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q08AU9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q08AU9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q08AU9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q08AU9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q08AU9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q08AU9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q08AU9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q08AU9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q08AU9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q08AU9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q08AU9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q08AU9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q08AU9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q08AU9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q08AU9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q08AU9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q08AU9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q08AU9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q08AU9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q08AU9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q08AU9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q08AU9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q08AU9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q08AU9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q08AU9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q08AU9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q08AU9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q08AU9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q08AU9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q08AU9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q08AU9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q08AU9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q08AU9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q08AU9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q08AU9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q08AU9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q08AU9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q08AU9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q08AU9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q08AU9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q08AU9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q08AU9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q08AU9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q08AU9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q08AU9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q08AU9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q08AU9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q08AU9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q08AU9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q08AU9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms