Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rbp2Q08652 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms