Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gata4Q08369 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gata4Q08369 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata4Q08369 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms