Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn1Q08091 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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