Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atf4Q06507 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Atf4Q06507 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atf4Q06507 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms