Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Thbs3Q05895 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Thbs3Q05895 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thbs3Q05895 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms