Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apoc2Q05020 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apoc2Q05020 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms