Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RelbQ04863 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RelbQ04863 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RelbQ04863 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RelbQ04863 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RelbQ04863 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelbQ04863 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelbQ04863 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RelbQ04863 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms