Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Emx1Q04742 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Emx1Q04742 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Emx1Q04742 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms