Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tff2Q03404 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tff2Q03404 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms