Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl7Q03366 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 253.8 ms