Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms