Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cacna1sQ02789 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cacna1sQ02789 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms