Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GscQ02591 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GscQ02591 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GscQ02591 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GscQ02591 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GscQ02591 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GscQ02591 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GscQ02591 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GscQ02591 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GscQ02591 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GscQ02591 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GscQ02591 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GscQ02591 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GscQ02591 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
GscQ02591 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GscQ02591 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GscQ02591 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GscQ02591 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GscQ02591 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GscQ02591 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GscQ02591 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GscQ02591 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GscQ02591 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GscQ02591 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GscQ02591 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GscQ02591 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GscQ02591 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GscQ02591 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GscQ02591 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GscQ02591 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GscQ02591 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GscQ02591 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GscQ02591 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GscQ02591 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GscQ02591 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GscQ02591 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GscQ02591 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GscQ02591 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GscQ02591 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GscQ02591 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GscQ02591 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GscQ02591 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GscQ02591 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GscQ02591 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GscQ02591 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GscQ02591 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GscQ02591 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GscQ02591 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GscQ02591 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GscQ02591 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GscQ02591 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GscQ02591 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GscQ02591 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GscQ02591 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GscQ02591 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GscQ02591 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GscQ02591 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GscQ02591 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GscQ02591 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GscQ02591 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GscQ02591 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GscQ02591 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GscQ02591 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GscQ02591 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GscQ02591 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GscQ02591 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GscQ02591 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GscQ02591 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GscQ02591 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GscQ02591 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GscQ02591 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GscQ02591 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GscQ02591 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GscQ02591 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GscQ02591 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GscQ02591 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GscQ02591 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GscQ02591 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GscQ02591 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GscQ02591 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GscQ02591 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GscQ02591 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GscQ02591 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GscQ02591 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GscQ02591 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GscQ02591 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GscQ02591 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GscQ02591 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GscQ02591 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GscQ02591 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GscQ02591 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GscQ02591 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GscQ02591 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GscQ02591 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GscQ02591 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GscQ02591 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GscQ02591 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GscQ02591 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GscQ02591 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GscQ02591 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms