Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nhlh1Q02576 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nhlh1Q02576 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms