Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms