Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gja5Q01231 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gja5Q01231 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gja5Q01231 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gja5Q01231 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gja5Q01231 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gja5Q01231 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gja5Q01231 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gja5Q01231 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gja5Q01231 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gja5Q01231 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gja5Q01231 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gja5Q01231 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gja5Q01231 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gja5Q01231 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gja5Q01231 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gja5Q01231 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gja5Q01231 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gja5Q01231 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gja5Q01231 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gja5Q01231 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gja5Q01231 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gja5Q01231 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gja5Q01231 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gja5Q01231 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gja5Q01231 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gja5Q01231 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gja5Q01231 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gja5Q01231 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gja5Q01231 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gja5Q01231 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gja5Q01231 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gja5Q01231 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gja5Q01231 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gja5Q01231 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gja5Q01231 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gja5Q01231 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gja5Q01231 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gja5Q01231 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms