Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin2cQ01098 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin2cQ01098 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Grin2cQ01098 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Grin2cQ01098 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Grin2cQ01098 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Grin2cQ01098 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Grin2cQ01098 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Grin2cQ01098 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms