Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SeleQ00690 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SeleQ00690 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SeleQ00690 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SeleQ00690 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SeleQ00690 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SeleQ00690 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SeleQ00690 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SeleQ00690 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SeleQ00690 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SeleQ00690 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms