Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabpb1Q00420 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabpb1Q00420 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms