Protein–RNA interactions for Protein: P98197

Atp11a, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11aP98197 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp11aP98197 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp11aP98197 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp11aP98197 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp11aP98197 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp11aP98197 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp11aP98197 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp11aP98197 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp11aP98197 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp11aP98197 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp11aP98197 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp11aP98197 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp11aP98197 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp11aP98197 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp11aP98197 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp11aP98197 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp11aP98197 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp11aP98197 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp11aP98197 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp11aP98197 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp11aP98197 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp11aP98197 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp11aP98197 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp11aP98197 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp11aP98197 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp11aP98197 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms