Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited1P97769 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited1P97769 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited1P97769 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms