Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarcc1P97496 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Smarcc1P97496 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms