Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Npas1P97459 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Npas1P97459 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas1P97459 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Npas1P97459 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Npas1P97459 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Npas1P97459 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms