Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp1b3P97370 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp1b3P97370 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp1b3P97370 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp1b3P97370 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp1b3P97370 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp1b3P97370 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp1b3P97370 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp1b3P97370 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp1b3P97370 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp1b3P97370 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp1b3P97370 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp1b3P97370 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp1b3P97370 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp1b3P97370 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp1b3P97370 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp1b3P97370 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp1b3P97370 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp1b3P97370 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp1b3P97370 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp1b3P97370 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp1b3P97370 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp1b3P97370 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp1b3P97370 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp1b3P97370 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp1b3P97370 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp1b3P97370 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Atp1b3P97370 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms