Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nkx2-3P97334 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nkx2-3P97334 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms