Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43cP86449 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim43cP86449 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim43cP86449 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim43cP86449 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms