Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctps1P70698 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctps1P70698 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctps1P70698 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctps1P70698 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctps1P70698 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms