Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rad50P70388 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rad50P70388 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rad50P70388 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rad50P70388 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rad50P70388 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad50P70388 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad50P70388 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rad50P70388 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Rad50P70388 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rad50P70388 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rad50P70388 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad50P70388 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms