Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp4P70343 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp4P70343 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp4P70343 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp4P70343 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp4P70343 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp4P70343 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp4P70343 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp4P70343 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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