Protein–RNA interactions for Protein: P70295

Aup1, Ancient ubiquitous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aup1P70295 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aup1P70295 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aup1P70295 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aup1P70295 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aup1P70295 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aup1P70295 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aup1P70295 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aup1P70295 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aup1P70295 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aup1P70295 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aup1P70295 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Aup1P70295 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms