Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vamp7P70280 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms