Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad54lP70270 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms