Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SbdsP70122 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SbdsP70122 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SbdsP70122 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SbdsP70122 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SbdsP70122 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SbdsP70122 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms