Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps27aP62983 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms