Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl39P62892 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl39P62892 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl39P62892 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl39P62892 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl39P62892 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl39P62892 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl39P62892 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl39P62892 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl39P62892 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl39P62892 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl39P62892 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl39P62892 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl39P62892 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl39P62892 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl39P62892 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl39P62892 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl39P62892 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl39P62892 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl39P62892 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl39P62892 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl39P62892 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl39P62892 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl39P62892 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl39P62892 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl39P62892 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl39P62892 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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