Protein–RNA interactions for Protein: P62852

Rps25, 40S ribosomal protein S25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps25P62852 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps25P62852 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps25P62852 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps25P62852 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps25P62852 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps25P62852 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rps25P62852 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps25P62852 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps25P62852 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps25P62852 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps25P62852 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps25P62852 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps25P62852 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps25P62852 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms